从电泳结果(图1)可以看出，当溴化氰与Met的摩尔数比较低时(50∶1)切割效率很低，当比例为250∶1时有较高的切割效率，但继续增加比例切割效果没有明显变化。

  而盐酸浓度及不同溶剂对切割效率的影响为：

  从电泳结果(图2)可以看出，在8 mol/L尿素溶液(含0.1 mol/L HCl)，8 mol/L尿素溶液(含1 mol/LHCl)中都出现了目的肽段(Mr2 200处)且盐酸浓度越高切割效率越高，而在8 mol/L尿素溶液中切割效率极低。

  M.低Mr蛋白标准：

  （1）溴化氰在8mol/L尿素溶液的条件下裂解包涵体的结果；

  （2）溴化氰在8mol/L尿素溶液（含0.1mol/L HCl）的条件下裂解包涵体的结果；

  （3）溴化氰在8mol/L尿素溶液（含1mol/L HCl）的条件下裂解包涵体的结果；

  （4）溴化氰在百分之七十甲酸的条件下裂解包涵体的结果。

  在百分之七十甲酸中虽然融合蛋白被切割但是肽段切割不完全，没有切割出目的肽段(可能是G13与前面含有7个氨基酸的阴离子肽段之间的Met没有被切割)，说明高效率的溴化氰切割需要在酸性条件下进行，且溴化氰在促溶剂(尿素)的酸溶液中切割融合蛋白比在百分之七十甲酸中切割的更完全，更有利于小肽切割。